Terminliste
| 17.08.2012 | 1. runde | La Liga 2 | Villarreal | 2 - 1 | Real Madrid Castilla | ||
| 25.08.2012 | 2. runde | La Liga 2 | Sabadell | 0 - 0 | Villarreal | ||
| 01.09.2012 | 3. runde | La Liga 2 | Villarreal | 2 - 1 | Guadalajara | ||
| 08.09.2012 | 4. runde | La Liga 2 | Ponferradina | 0 - 1 | Villarreal | ||
| 16.09.2012 | 5. runde | La Liga 2 | Villarreal | 1 - 0 | Hércules | ||
| 22.09.2012 | 6. runde | La Liga 2 | Las Palmas | 2 - 2 | Villarreal | ||
| 29.09.2012 | 7. runde | La Liga 2 | Villarreal | 2 - 0 | Córdoba | ||
| 07.10.2012 | 8. runde | La Liga 2 | Sporting | 2 - 0 | Villarreal | ||
| 13.10.2012 | 9. runde | La Liga 2 | Villarreal | 1 - 1 | Huesca | ||
| 21.10.2012 | 10. runde | La Liga 2 | Recreativo | 2 - 0 | Villarreal | ||
| 27.10.2012 | 11. runde | La Liga 2 | Villarreal | 2 - 0 | Mirandés | ||
| 03.11.2012 | 12. runde | La Liga 2 | Numancia | 1 - 1 | Villarreal | ||
| 11.11.2012 | 13. runde | La Liga 2 | Villarreal | 1 - 1 | Murcia | ||
| 17.11.2012 | 14. runde | La Liga 2 | Racing Santander | 0 - 3 | Villarreal | ||
| 24.11.2012 | 15. runde | La Liga 2 | Villarreal | 1 - 1 | Lugo | ||
| 02.12.2012 | 16. runde | La Liga 2 | Elche | 1 - 0 | Villarreal | ||
| 09.12.2012 | 17. runde | La Liga 2 | Villarreal | 4 - 0 | Alcorcón | ||
| 15.12.2012 | 18. runde | La Liga 2 | Girona | 2 - 0 | Villarreal | ||
| 20.12.2012 | 19. runde | La Liga 2 | Xerez | 0 - 0 | Villarreal | ||
| 05.01.2013 | 20. runde | La Liga 2 | Villarreal | 1 - 3 | Barcelona B | ||
| 12.01.2013 | 21. runde | La Liga 2 | Almería | 1 - 1 | Villarreal | ||
| 19.01.2013 | 22. runde | La Liga 2 | Real Madrid Castilla | 5 - 0 | Villarreal | ||
| 25.01.2013 | 23. runde | La Liga 2 | Villarreal | 3 - 0 | Sabadell | ||
| 02.02.2013 | 24. runde | La Liga 2 | Guadalajara | 0 - 0 | Villarreal | ||
| 09.02.2013 | 25. runde | La Liga 2 | Villarreal | 3 - 0 | Ponferradina | ||
| 17.02.2013 | 26. runde | La Liga 2 | Hércules | 1 - 1 | Villarreal | ||
| 24.02.2013 | 27. runde | La Liga 2 | Villarreal | 1 - 1 | Las Palmas | ||
| 03.03.2013 | 28. runde | La Liga 2 | Córdoba | 0 - 2 | Villarreal | ||
| 10.03.2013 | 29. runde | La Liga 2 | Villarreal | 2 - 1 | Sporting | ||
| 16.03.2013 | 30. runde | La Liga 2 | Huesca | 0 - 1 | Villarreal | ||
| 24.03.2013 | 31. runde | La Liga 2 | Villarreal | 1 - 1 | Recreativo | ||
| 31.03.2013 | 32. runde | La Liga 2 | Mirandés | 1 - 5 | Villarreal | ||
| 07.04.2013 | 33. runde | La Liga 2 | Villarreal | 6 - 1 | Numancia | ||
| 14.04.2013 | 34. runde | La Liga 2 | Murcia | 1 - 1 | Villarreal | ||
| 21.04.2013 | 35. runde | La Liga 2 | Villarreal | 1 - 0 | Racing Santander | ||
| 27.04.2013 | 36. runde | La Liga 2 | Lugo | 0 - 0 | Villarreal | ||
| 05.05.2013 | 37. runde | La Liga 2 | Villarreal | 2 - 3 | Elche | ||
| 12.05.2013 | 38. runde | La Liga 2 | Alcorcón | 1 - 3 | Villarreal | ||
| 18.05.2013 | 39. runde | La Liga 2 | Villarreal | 4 - 1 | Girona | ||
| 27.05.2013 | 40. runde | La Liga 2 | Villarreal | 3 - 2 | Xerez | ||
| 02.06.2013 | 41. runde | La Liga 2 | Barcelona B | 0 - 3 | Villarreal | ||
| 08.06.2013 | 42. runde | La Liga 2 | Villarreal | 1 - 0 | Almería |
Spillerstall
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